在微生物診斷中，實驗室離心機通常用于將被測微生物與被測材料分離，獲得純培養物（即單個微生物的培養物），因此，實驗室離心機通常用于分離樣品。. 微生物的離心分離培養是微生物診斷的重要基礎操作。

有許多方法可以分離單個微生物。

1、將待測材料接種于合適的微生物培養基中，然后從固體培養基表面產生的細菌中選擇一種待分離的細菌，將其轉移到另一種合適的微生物培養基中進行培養。由于單個菌體通常是由單個細菌產生和繁殖的，因此培養的細菌屬于單一類型，即純培養；

2、利用獨特的培養環境（如厭氧、二氧化碳環境等）進行細菌分離；

將待測物質接收到易感動物體內，使病原菌在動物體內繁殖，然后將物質從動物體內取出并離心分離出所需成分，然后進行培養。使用對某些物理化學元素具有獨特抵抗力的細菌，通過物理化學方法對接種物進行處理，殺死其他微生物，并保留分離培養所需的細菌。

一般來說，可以使用前兩種方法分離和培養測試材料。如果被測物質污染嚴重，可以先用后兩種方法，再用前兩種方法進行純培養。

在分離培養操作中，進行嚴格的無菌操作。所有耗材、微生物培養基和試劑都必須經過滅菌處理，不能長時間暴露在空氣中。禁止用手觸摸或吹動消毒過的器具內部。

受試材料中可能存在病原苗的特性，應選擇合適的微生物培養基和培養條件：（溫度、氣體環境等）。初次分離未知菌時，最好使用幾種微生物培養基微生物接種方法穿刺法，如肉湯、血瓊脂、麥康克瓊脂等。每種微生物培養基接種數個試管，分別置于正常環境和厭氧環境中。滋養。在 24-78 小時內觀察到結果，但一些病原體需要長時間孵育才能產生。

被測材料通常不需要處理，可以直接在微生物培養基上生長。當懷疑是帶芽腦病原苗時，加入生理鹽水將待測物研磨成1:10的乳劑（液體材料無需稀釋），放入60-80℃的水浴中20-30分鐘微生物接種方法穿刺法，殺滅孢子的細菌，然后將其接種到微生物培養基中。